Dane kontaktowe: tel. 41 367 42 58
Kierownik: dr n. med. Artur Kowalik - spec. laboratoryjny genetyki medycznej
Z-ca kierownika: dr n. med. Małgorzata Chłopek
Działalność medyczna:
Zakład Diagnostyki Molekularnej wywodzi się z Pracowni Biologii Molekularnej utworzonej w 2003 roku w obrębie Zakładu Patologii Nowotworów. W 2008 roku Pracownia Biologii Molekularnej została wyłączona jako samodzielna Pracownia Diagnostyki Molekularnej, a w 2012 roku na bazie Pracowni utworzono Zakład Diagnostyki Molekularnej.
W skład Zakładu Diagnostyki Molekularnej wchodzi również BIOBANK ŚCO, który służy gromadzeniu materiału do badań naukowych.
Wykorzystujemy techniki:
- masywne równoległe sekwencjonowanie (next generation sequencing - NGS)
- sekwencjonowanie kapilarne DNA
- qPCR, PCR, RT-PCR
- digital PCR
- fotocytomter ImagreStream Mark II.
W Zakładzie wykonujemy badania technikami biologii molekularnej na potrzeby pacjentów leczonych w ŚCO. Wykonywane badania można podzielić na trzy główne typy:
- wykrywanie predyspozycji dziedzicznych do rozwoju chorób nowotworowych (np. BRCA1); badania te są realizowane w ścisłej współpracy z Poradnią Genetyczną ŚCO,
- selekcjonowanie pacjentów do terapii celowanych (rak jelita grubego – KRAS, NRAS; czerniak-BRAF, niedrobnokomórkowy rak płuca- EGFR),
- diagnostyka i monitorowanie skuteczności w nowotworach hematologicznych (np. CML, ALL, AML, PV i inne).
Działalność badawcza:
Działalność badawcza koncentruje się wokół poszukiwania nowych genów dla diagnostyki i terapii nowotworów z użyciem m. in. techniki NGS. Prowadzimy również badania dotyczące wykorzystania krążących komórek nowotworowych (CTC) , pozakomórkowych kwasów nukleinowych (cfNA) oraz exosomów jako źródła materiału diagnostycznego tzw. „liquid biopsy”.
Personel:
Diagności laboratoryjni:
dr n med. Artur Kowalik
mgr Małgorzata Chłopek
mgr Justyna Miłek-Krupa
mgr Ewelina Nowak-Ozimek
mgr Elżbieta Wypiórkiewicz
mgr Renata Chodurska
mgr Anna Fatyga
mgr Krzysztof Gruszczyński
mgr inż. Joanna Kalisz
mgr Hińcza Kinga
mgr Karol Krawczyk
mgr Kamila Krawiec
mgr Magdalena Szczepaniak
mgr Karolina Wąsowska
mgr Sebastian Zięba
Pracownicy techniczni:
mgr Liliana Pięciak
mgr Lech Magdalena
Współpraca naukowo – badawcza:
Zakład prowadzi również badania naukowe z ośrodkami w kraju:
CO-I Warszawa, Dr hab. Magdalena Kowalewska
http://www.coi.waw.pl/?go=content&contentID=112
Współpraca w zakresie analizy biologii nowotworów ginekologicznych.
CO-I Kraków Prof. Janusz Ryś http://co-instytut-krakow.publicznecentraonkologii.pl/prof-dr-hab-med-janusz-rys/
Współpraca w zakresie biologii mięsaków oraz nowotworów piersi.
WUM Dr hab. Katarzyna Koziak, Dr hab. Magdalena Kowalewska, http://www.escyna.wum.edu.pl/content/pracownicy
https://ziz.wum.edu.pl/node/5
Współpraca z zakresie procesów regulujących angiogenezę zapalną i nowotworową
Wojskowa Akademia Techniczna
Dr hab. Zdzisław Bogdanowicz, Dr Andrzej Górka
http://www.wme.wat.edu.pl/viewpage.php?page_id=3
Współpraca w zakresie budowy sit molekularnych dla zaawansowanej diagnostyki.
Instytut Fizyki PAN
Prof. Danek Elbaum, Dr Bożena Sikora
http://info.ifpan.edu.pl/
Współpraca dotyczy wykorzystania ukonwertujących nanocząstek do
diagnostyki oraz leczenia chorób nowotworowych."
Instytut Wysokich Ciśnień PAN
Prof. Witold Łojkowski, Dr Anna Świderska-Środa
http://labnano.pl/
Współpraca w zakresie wykorzystania nanocząstek w diagnostyce i leczeniu chorób nowotworowych.
Prof. Jan Weyher, Dr Igor Dzięcielewski
https://www.unipress.waw.pl/
https://www.unipress.waw.pl/index.php?option=com_content&view=category&id=68%3Aproducts&Itemid=117&layout=default&lang=pl
Wydział Chemii, UW
Dr hab. Andrzej Kudelski
http://pom.chem.uw.edu.pl/groups/andrzej-kudelski-group/
http://www.chem.uw.edu.pl/
http://pom.chem.uw.edu.pl/people/group-leaders/andrzej-kudelski/
Współpraca w zakresie wykorzystania podłoży SERS do ultraczułej
diagnostyki.
GUMED Dr hab. Bartosz Wasąg http://www.genetyka.gumed.edu.pl/profile/bwasag.html
Współpraca w zakresie biologii nowotworów litych (GIST, rak jelita grubego i inne).
Współpracujemy również z instytutami badawczymi z zagranicy: NCI, Waszyngton, USA.
