Dane kontaktowe: tel. 41 367 42 58
Kierownik: dr hab. n. med. Artur Kowalik - spec. laboratoryjnej genetyki medycznej
Z-ca kierownika: dr n. med. Małgorzata Chłopek - spec. laboratoryjnej genetyki medycznej
Działalność medyczna:
Zakład Diagnostyki Molekularnej wywodzi się z Pracowni Biologii Molekularnej utworzonej w 2003 roku w obrębie Zakładu Patologii Nowotworów. W 2008 roku Pracownia Biologii Molekularnej została wyłączona jako samodzielna Pracownia Diagnostyki Molekularnej, a w 2012 roku na bazie Pracowni utworzono Zakład Diagnostyki Molekularnej.
W skład Zakładu Diagnostyki Molekularnej wchodzi również BIOBANK ŚCO, który służy gromadzeniu materiału do badań naukowych.
Wykorzystujemy techniki:
- masywne równoległe sekwencjonowanie (next generation sequencing - NGS)
- sekwencjonowanie kapilarne DNA
- qPCR, PCR, RT-PCR
- digital PCR
- fotocytomter ImageStream Mark II.
W Zakładzie wykonujemy badania technikami biologii molekularnej na potrzeby pacjentów leczonych w ŚCO. Wykonywane badania można podzielić na trzy główne typy:
- wykrywanie predyspozycji dziedzicznych do rozwoju chorób nowotworowych (np. BRCA1); badania te są realizowane w ścisłej współpracy z Poradnią Genetyczną ŚCO,
- stratyfikacja pacjentów do terapii celowanych (rak jelita grubego – KRAS, NRAS; czerniak-BRAF, niedrobnokomórkowy rak płuca- EGFR),
- diagnostyka i monitorowanie skuteczności leczenia w nowotworach hematologicznych (np. CML, ALL, AML, PV i inne).
Działalność badawcza:
Działalność badawcza koncentruje się wokół poszukiwania nowych genów dla diagnostyki i terapii nowotworów z użyciem m. in. techniki NGS. Prowadzimy również badania dotyczące wykorzystania krążących komórek nowotworowych (CTC), oraz pozakomórkowych kwasów nukleinowych (cfNA) jako źródła materiału diagnostycznego tzw. „liquid biopsy”.
Personel:
Diagności laboratoryjni:
dr hab. n med. Artur Kowalik
dr n. med. Małgorzata Chłopek
mgr Ewelina Nowak-Ozimek
mgr Elżbieta Wypiórkiewicz
mgr Renata Chodurska
mgr Anna Fatyga
mgr Krzysztof Gruszczyński
mgr inż. Joanna Kalisz
mgr Kamila Krawiec
mgr Liliana Zięba
mgr Sebastian Zięba
Biolodzy, biotechnolodzy:
mgr Kinga Hińcza
mgr Karol Krawczyk
mgr Magdalena Lech
mgr Justyna Miłek-Krupa
mgr Magdalena Stawiarz
mgr Magdalena Szczepaniak
mgr Karolina Wąsowska
Współpraca naukowo – badawcza:
Zakład prowadzi również badania naukowe z ośrodkami w kraju:
CO-I Warszawa
Dr hab. Magdalena Kowalewska http://www.coi.waw.pl/?go=content&contentID=112
Współpraca w zakresie analizy biologii nowotworów ginekologicznych.
CO-I Kraków
Prof. Janusz Ryś http://co-instytut-krakow.publicznecentraonkologii.pl/prof-dr-hab-med-janusz-rys/
Współpraca w zakresie biologii mięsaków oraz nowotworów piersi.
Wojskowa Akademia Techniczna
Dr hab. Zdzisław Bogdanowicz, Dr Barbara Nasiłowska
http://www.wme.wat.edu.pl/viewpage.php?page_id=3
Współpraca w zakresie budowy sit molekularnych dla zaawansowanej diagnostyki.
Instytut Fizyki PAN
Prof. Danek Elbaum, Dr Bożena Sikora
http://info.ifpan.edu.pl/
Współpraca dotyczy wykorzystania ukonwertujących nanocząstek do diagnostyki oraz leczenia chorób nowotworowych.
Instytut Wysokich Ciśnień PAN
Prof. Witold Łojkowski, Dr Anna Świderska-Środa
http://labnano.pl/
Współpraca w zakresie wykorzystania nanocząstek w diagnostyce i leczeniu chorób nowotworowych.
Prof. Jan Weyher
https://www.unipress.waw.pl/
Współpraca w zakresie wykorzystania podłoży SERS do ultraczułej diagnostyki.
Wydział Chemii, UW
Dr hab. Andrzej Kudelski
http://www.chem.uw.edu.pl/wydzial/wladze/dr-hab-andrzej-kudelski-prof-uw/
Współpracujemy również z instytutami badawczymi z zagranicy:
National Cancer Institute, General Surgical Pathology Section Building 10, Room 2S235C Bethesda, MD 20892, USA.
Dr Jerzy Lasota
Współpraca w zakresie badań biologii molekularnej nowotworów w tym GIST, czerniak oraz rak jelita grubego.
